Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIFKQ9BYG3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms