Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms