Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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