Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms