Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC32Q9BV29 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms