Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms