Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL2Q9BQD1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms