Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL4Q9BPW4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL4Q9BPW4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms