Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF5Q99942 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF5Q99942 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RNF5Q99942 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RNF5Q99942 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RNF5Q99942 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RNF5Q99942 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RNF5Q99942 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RNF5Q99942 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RNF5Q99942 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF5Q99942 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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