Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYCBPQ99417 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms