Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDRT15Q96T59 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDRT15Q96T59 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDRT15Q96T59 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDRT15Q96T59 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDRT15Q96T59 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms