Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms