Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms