Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALS2CR12Q96Q35 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms