Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCGB3A2Q96PL1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms