Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms