Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms