Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COG3Q96JB2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms