Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TPD52L3Q96J77 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms