Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED3Q96IU2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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