Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms