Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MALSU1Q96EH3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms