Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPDL1Q96EA4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPDL1Q96EA4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPDL1Q96EA4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SPDL1Q96EA4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms