Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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FAM3DQ96BQ1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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