Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTTNBP2Q8WZ74 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms