Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC12Q8WUD4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms