Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms