Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00301Q8NCQ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms