Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms