Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L2Q8NAA4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms