Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSIP1Q8NA03 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSIP1Q8NA03 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSIP1Q8NA03 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSIP1Q8NA03 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSIP1Q8NA03 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSIP1Q8NA03 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms