Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD53Q8N9V6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms