Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF148Q8N7C7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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RNF148Q8N7C7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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RNF148Q8N7C7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNF148Q8N7C7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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