Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TTC9CQ8N5M4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TTC9CQ8N5M4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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