Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms