Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLNKQ7Z7G1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms