Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTF1AQ7RTS3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms