Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC80Q76M96 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms