Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q71RC1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q71RC1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q71RC1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q71RC1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms