Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BEND4Q6ZU67 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms