Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TPGS1Q6ZTW0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPGS1Q6ZTW0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms