Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms