Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms