Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms