Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRSAM1Q6UWE0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRSAM1Q6UWE0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms