Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms