Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RWDD4Q6NW29 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RWDD4Q6NW29 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms