Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRNP1Q6NT89 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms