Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK5

TSHZ3, Teashirt homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ3Q63HK5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSHZ3Q63HK5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ3Q63HK5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms