Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms